Peamine erinevus oksüdaaside ja oksügenaaside vahel on see, et oksüdaasid on ensüümid, mis katalüüsivad oksüdatsiooni-redutseerimise reaktsioone, viies vesiniku substraadilt hapnikule ja moodustades seega vett või vesinikperoksiidi, samal ajal kui oksüdaasid on ensüümid, mis katalüüsivad otsest liitumist hapniku molekulaarsest hapnikust (O 2) substraadile oksüdatsiooni käigus konkreetse substraadiga.
Ensüümid on valgumolekulid, mis katalüüsivad elusorganismide rakkudes esinevaid biokeemilisi reaktsioone. Vastavalt sellele suurendavad nad reaktsiooni kiirust, vähendades reaktsiooni aktivatsiooni energiat. Seega toimuvad reaktsioonid suurel kiirusel. Mõni ensüüm katalüüsib ka kompleksmolekulide lagunemist monomeerideks, osa ensüüme aga biomolekulide moodustumist nende monomeeridest. Samamoodi on oksüdaasid ja oksügenaasid kahte tüüpi ensüüme, mis esinevad kõigis elusorganismides.
