Peamine erinevus kaltsiumhüpokloriti ja naatriumhüpokloriti vahel on see, et kaltsiumhüpoklorit sisaldab kahte hüpokloritiooni, mis on seotud ühe kaltsiumikatiooniga, samas kui naatriumhüpoklorit sisaldab ühte hüpokloritiooniooni, mis on seotud ühe naatriumkatiooniga. Välimuselt on kaltsiumhüpoklorit valge kuni hall pulber, naatriumhüpoklorit on rohekaskollane, magusa lõhnaga tahke aine.
Kaltsium ja naatriumhüpoklorit on ioonsed ühendid, mis sisaldavad metallkatiooni ja kloorist saadud aniooni. Nende ühendite anioonide arv katioonis erineb üksteisest metalli katiooni valentsuse järgi.
