Peamine erinevus mikroobide ja bakterite vahel on see, et mõiste idu tähistab igat tüüpi mikroskoopilisi osakesi, sealhulgas baktereid, seeni, algloomasid, viirusi jne, mis võivad meid haigeks teha, samas kui bakterid on idurakud, mis on üherakulised prokarüootsed organismid.
Haigust põhjustavaid mikroorganisme on erinevaid, nagu bakterid, viirused, algloomad, seened, prioonid jne, mida me nimetame mikroobideks. Peale nende mikroobide hõlmavad mikroobid ka haigusi põhjustavaid esemeid nagu eosed, toksiinid jne. Kõik need idud on meile kahjulikud. Kõiki baktereid arvesse võttes on enamik baktereid siiski kahjutud. Vaid vähesed põhjustavad elusorganismidele haigusi. Seetõttu on see väike protsent haigusi põhjustavaid baktereid mikroobidena, kuna need on kahjulikud.
