Peamine erinevus parasiidi ja bakterite vahel on see, et bakterid on üherakulised mikroskoopilised prokarüoodid, mis elavad kõikjal, samal ajal kui parasiidid on organismid, mis elavad peremeestes või nende peremeesorganismides, põhjustades samas peremeestele nakkusi.
Parasiidid ja bakterid on organismid, mis sarnanevad väga primitiivsete organismidega, kuid millel on suurepärased kohanemisvõimalused erinevates keskkonnatingimustes ellujäämiseks. Inimeste jaoks on need organismid esmatähtsad, kuna enamik inimeste nakkustest on põhjustatud just neist. Mõnikord peetakse teatud baktereid parasiitideks.