Peamine erinevus D- ja L-glükoosi vahel on see, et D-glükoosis on paremal küljel kolm hüdroksüülrühma ja üks vesinikurühm, samas kui L-glükoosis on kolm hüdroksüülrühma ja üks vesinikurühm vasakul küljel.
D-glükoosi ja L-glükoosi nimedes kasutatavaid tähti "D" ja "L" kasutatakse glükoosimolekuli struktuuriliste erinevuste eristamiseks. Neid kahte vormi nimetatakse enantiomeerideks, kuna nende molekulaarstruktuurid on üksteise peegelpildid. Seetõttu peitub D ja L glükoosi peamine erinevus nende struktuuris. Nende kuju erinevusi saame selgitada Fisheri projektsioonimudeli abil; see on üks orgaaniliste molekulide joonistamise viise.
