Bioreaktori ja fermentori peamine erinevus seisneb suletud anumate sees toimuva biokeemilise reaktsiooni tüübis. Bioreaktor hõlbustab igasuguseid biokeemilisi reaktsioone, kuid fermentor hõlbustab ainult fermentatsiooni.
Biotehnoloogia rakendamine tööstuses on huvitav teadusvaldkond. Need rakendused varieeruvad mikroobirakendustest loomapõhiste rakendusteni. Lisaks varieeruvad biotehnoloogia tööstuslikud rakendused peamistes valdkondades, näiteks põllumajanduses, meditsiinis ja erinevates tööstusharudes. Bioreaktorid on suletud anumad, milles luuakse vajalikud tingimused erinevat tüüpi biokeemiliste reaktsioonide hõlbustamiseks. Fermentorid kuuluvad bioreaktorite rühma, kuid see on mõeldud ainult kääritamiseks.