Peamine erinevus allelopaatia ja antibioosi vahel põhineb iga nähtuse põhjustatud mõju tüübil. Allelopaatia toob kaasa nii positiivse kui ka negatiivse mõju kahe või enama organismi suhetele, samas kui antibioosus avaldab negatiivset mõju ühele suhtes osalenud organismile.
Toitumine mängib olulist rolli organismide ellujäämisel. Selles kontekstis on organismide suhe toitainevajaduse jaoks ülitähtis. Nii allelopaatia kui ka antibioos on suhted, mis toimuvad kahe või enama organismi vahel. Kuid nad reageerivad üksteisele erinevates vormides.
