Peamine erinevus kloonide kloonimise ja jahipüssi sekveneerimise vahel seisneb nende käitumismeetodis. Kloonimine sekveneerimismeetodiga hõlmab kromosoomide kaardistamist ja kloneerimist enne sekveneerimist, samas kui püssijahutusega kloonimine jätab sekveneerimise käigus ära nii kromosoomide kaardistamise kui ka kloonimise etapid.
Kloon kloonimise teel ja kloon haavlipüssjärjestusega on tänapäeva genoomi järjestamise kaks meetodit. Kloonimine kloonide järjestamise teel on usaldusväärsem sekveneerimismeetod. Kloonimismeetod jahipüssi sekveneerimisega on aga kiirem ja odavam. Artikkel keskendub kloonide järjestuse ja jahipüssi sekveneerimise vahelisele peenele erinevusele.
