Põhiline erinevus substraadi ja aktiivse saidi vahel on see, et substraat on keemiline ühend, mis võib läbida keemilise reaktsiooni, samas kui aktiivne koht on ensüümi spetsiifiline piirkond.
Ensüümid on bioloogilised katalüsaatorid. Need on valgud, mis võivad vähendada keemilise reaktsiooni aktivatsioonienergiat, et vähendada selle reaktsiooni energiabarjääri. Seega võib see suurendada reaktsiooni kiirust. Ensüümidega seotud reaktsiooni reagent on “substraat”. See substraat seondub ensüümi aktiivse kohaga. Reaktsioonid toimuvad seal. Lõpuks vabastab see reaktsioonisaadused.