Peamine erinevus substraadi spetsiifilisuse ja sidemete spetsiifilisuse vahel on see, et substraadi spetsiifilisus on ensüümi võime valida sarnase ühendi rühma seast täpne substraat, millega ta saab liituda, samas kui sideme spetsiifilisus on ensüümi võime valida substraate, millel on sarnased sidemed ja sarnaseid struktuure.
Mõisted substraadi spetsiifilisus ja sideme spetsiifilisus kuuluvad ensüümide aktiivsuse osas biokeemia valdkonda. Ensüümi saame määratleda bioloogilise katalüsaatorina. See tähendab, et ensüümid on ühendid, mis võivad kiirendada rakkudes toimuvate bioloogiliste funktsioonide kiirust, kuid neid funktsiooni ajal ei tarbita. Termin spetsiifilisus viitab teatud ensüümi sidumisele kindla substraadiga.
