Peamine erinevus pluripotentsete ja indutseeritud pluripotentsiaalsete tüvirakkude vahel on see, et pluripotentsed rakud on diferentseerumata emarakud (embrüotest jne), millel on loomulik võime diferentseeruda erinevateks rakutüüpideks, samas kui indutseeritud pluripotentsed tüvirakud on täiskasvanud somaatilised rakud, millel on geneetiliselt ümber programmeeritud, et näidata sarnaseid omadusi nagu looduslikud pluripotentsed tüvirakud.
Tüvirakk on diferentseerimata rakk, millel on ainulaadne võime areneda erinevateks või spetsialiseerunud rakkudeks. Lisaks on tüvirakke kolme tüüpi, nimelt unipotentsed, pluripotentsed ja multipotentsed. Kui tüvirakk suudab diferentseeruda üheks, mitmeks ja kõigiks rakutüüpideks, on see tuntud kui ühe-, mitme- või pluripotentne tüvirakk. Eeltoodud kolme tüübi hulgas on pluripotentsed tüvirakud olulised, kuna need võivad kõigiks rakutüüpideks eristada. Pluripotentsest embrüonaalsest tüvirakust võib areneda terve inimene.