Peamine erinevus prootoni ja elektroni vahel on see, et prooton on aatomi tuumas leiduv subatoomne osake, samas kui elektronid on tuuma ümber tiirlevad osakesed.
Aatomid on kõigi olemasolevate ainete ehituskivid. Aatom sisaldab tuuma, millel on prootonid ja neutronid. Elektronid ringlevad orbiitide tuuma ümber. Lisaks on tuumas ka teisi väikeseid aatomi osakesi. Suurem osa aatomi ruumist on tühi. Atraktiivsed jõud positiivselt laetud tuuma (prootonite tõttu positiivne laeng) ja negatiivselt laetud elektronide vahel hoiavad aatomi kuju.
