Peamine erinevus endotsütoosi ja eksotsütoosi vahel on see, et endotsütoos viib ained rakku, samal ajal kui eksotsütoos transpordib aineid raku välisküljele.
Rakul on rakumembraan, mis toimib barjäärina raku sisemuse ja väliskeskkonna vahel. Seetõttu vajavad rakud sellise membraani olemasolu korral väliskeskkonnaga ühenduse loomiseks mingit transpordimehhanismi. Näiteks peavad rakud hankima toitaineid ja väljutama rakust jäätmeid. Sel eesmärgil on rakkudel neli põhilist transpordimehhanismi: difusioon, osmoos, aktiivne transport ja lahtine transport. Difusioon ja osmoos on passiivsed protsessid, aktiivne transport ja puistevedu on aktiivsed protsessid, mis tarbivad energiat. Endotsütoos ja eksotsütoos on kahte tüüpi lahtised transpordimehhanismid, mis transpordivad suuri osakesi läbi plasmamembraani kas rakust väliskeskkonda või väliskeskkonnast rakku. Mõlemad need mehhanismid moodustavad transpordivahendina membraaniga seotud vesiikulid.
