Peamine erinevus - metaboolika vs metabonoomika
Metaboliidid on rakkudes ainevahetusreaktsioonides osalevad väikesed molekulid. Metaboliitide hulka kuuluvad metaboolsed vaheühendid, hormoonid, sekundaarsed metaboliidid, signaalmolekulid jne. Need on rakkude biokeemiliste reaktsioonide toimivad molekulid. Bioloogilise proovi või ühe organismi metaboliitide täielik komplekt on tuntud kui metabool. Metaboloom on dünaamiline kogu, mis muutub kehas iga sekund. Metaboloomika ja metabonoomika on kaks terminit, mis on seotud organismi metaboloomi uurimisega. Peamine erinevus metaboloomika ja metabonoomika vahel on see, et metaboloomika on rohkem mures normaalse endogeense ainevahetuse ja metaboolse profileerimise pärast raku või organi tasandil, metabonoomika aga rohkem metaboolse profiili laiendamise kohta keskkonnainfaktoritest, haigustest, soolestikust tingitud ainevahetuse häirete kohta. mikroorganismid ja metaboolse profileerimise võrdlemine jne. Metaboloomikat juhib peamiselt massispektromeetria ja metabonoomika kasutab metaboliitide analüüsimiseks NMR-spektroskoopiat.
SISU
1. Ülevaade ja peamine erinevus
2. Mis on
metaboolika 3. Mis on metabonoomika
4. Kõrvuti võrdlus - Metabolomics vs Metabonomics
5. Kokkuvõte
Mis on metaboolika?
Metaboloomika on rakkudes, biovedelikes, kudedes või organismides toimuvate ainevahetusprotsesside uurimine. See hõlmab rakuliste metaboliitide tuvastamist ja kvantifitseerimist heade analüüsi- ja statistiliste vahendite abil. Metaboloomikat peetakse oluliseks uuringuks, kuna see näitab teavet organismi ainevahetuse kohta.
Metaboolsete reaktsioonide substraatide ja saaduste uurimiseks kasutab metaboloomika analüütilise platvormina massispektromeetriat. Massispektromeetria näitab metaboliitide tüüpe ja nende kontsentratsioone, peegeldades rakkude või kudede tegelikku biokeemilist seisundit. Seega võib metaboloomikat pidada organismi molekulaarse fenotüübi parimaks esindajaks. Metaboloomika on organismide väikeste molekulide oomiline tehnoloogia ja seda võrreldakse teiste oomiliste uuringutega; metaboloomika on väga oluline, kuna see peegeldab otseselt rakkude biokeemilise reaktsiooni praegust seisundit.
Metaboloomiat võib pidada ka proteoomika pikenduseks, kuna see tekib valkude ensüümide aktiivsuse tõttu, nagu on näidatud järgmisel joonisel.
Joonis 01: Metaboloomika skeem
Mis on metabonoomika?
Metabonoomika on määratletud kui mitmeparameetriliste metaboolsete reaktsioonide kvantitatiivne mõõtmine kindlatel aegadel seoses patofüsioloogiliste stresside või geneetilise muundumisega. Seda rakendatakse tavaliselt inimeste toitumise ja ravimitele või haigustele reageerimise kohta läbi viidud uuringute puhul. Selle lähenemisviisi algatas Jeremy Nicholson Londoni Imperial College'is ja seda on kasutatud paljudes valdkondades, sealhulgas toksikoloogia, haiguste diagnoosimine, toitumine jne. Ajalooliselt oli metabonoomika üks esimesi meetodeid süsteemibioloogia ulatuse rakendamiseks uuringutes ainevahetust.
Metabonoomika on pigem mures biokeemiliste profiilide võrdlemise kui metaboolika üksikute metaboolsete ühendite tuvastamise pärast. Seetõttu saab metabonoomiat määratleda kui metaboloomika alamhulka. Selles rõhutatakse peamiselt erinevate populatsioonide metaboolsete profiilide võrdlemist haiguste, keskkonnastresside, geneetilise muundamise, toitumise, ravimite jms osas, sest metaboliidid on head markerid, mis annavad märku haigusseisunditest, ravimite mõjust, keskkonnastressidest, kokkupuutest toksiinidega, jne.
Metabonoomilised uuringud näitavad nii rakusiseseid kui ka rakuväliseid metaboliite. See kasutab suure jõudlusega tehnikaid suure hulga metaboliitide samaaegseks ja korduvaks analüüsimiseks, võimaldades rakkude füsioloogilist seisundit ajaliselt uurida. Samuti näitab see metaboliitide ja organismi patoloogilise seisundi vahelist seost. Metabonoomiliste uuringute toetamiseks võib kasutada genoomikat ja proteoomikat, kuna need on omavahel seotud, nagu on näidatud ülaltoodud joonisel.
Mis vahe on metaboolikal ja metabonoomikal?
Erinev artikkel keskel enne tabelit
Metaboloomika vs metabonoomika |
|
| Metaboloomika on organismi metaboliitide kogu komplekti uurimine | Metabonoomika on kvantitatiivne uuring elusüsteemide multiparameetriliste metaboolsete reaktsioonide kohta ajaliselt patofüsioloogilistele stiimulitele või geneetilisele modifikatsioonile. |
| Põhimure | |
| Metaboloomika tegeleb rohkem metaboolse profileerimise ja rakkudes leiduvate üksikute metaboliitide tuvastamisega. | Metabonoomika tegeleb rohkem metaboliitide või populatsioonide metaboolsete profiilide võrdlemisega geneetiliste modifikatsioonide, haiguste, keskkonnastresside, patoloogiliste stiimulite, ravimite jms osas. |
| Teave | |
| Metaboloomika keskendub peamiselt endogeensele ainevahetusele. | Metabonoomika ei piirdu ainult endogeense ainevahetusega. See laieneb, et leida teavet ainevahetuse häirete kohta, mis on põhjustatud sise- ja välisteguritest, nagu toitumisharjumused, toksiinid, haigusprotsessid jne. |
| Analüütilised tööriistad | |
| See kasutab peamise analüütilise platvormina massispektromeetriat | Metabonoomika kasutab peamise analüütilise platvormina NMR-spektroskoopiat. |
Kokkuvõte - Metaboloomika vs Metabonoomika
Metaboloom tähistab rakus või organismis leiduvate väikeste molekulide, metaboliitide komplekti. Metaboloomika on kogu metabooloomi uurimine metaboolse profiili loomiseks. Metaboloomika võimaldab teadlastel mõõta raku või organismi tegelikku füsioloogilist seisundit. Metabonoomika on osa metaboloomikast, mis laieneb teabe kogumiseks elusüsteemide mitmeparameetriliste metaboolsete reaktsioonide kohta patofüsioloogilistele stiimulitele ja geneetilistele modifikatsioonidele. Metabonoomika ei puuduta ainult individuaalset metaboolset profileerimist nagu metaboloomika; selles võrreldakse ainevahetusprofiile teiste teguritega nagu keskkonnastressid, haigused, toksiinid jne. Nii metaboolika kui metabonoomika hõlmavad organismide metaboliitide uuringuid, et mõõta rakkude tegelikku füsioloogilist seisundit. Seegamõnikord käsitletakse neid kahte sünonüümidena, arvestamata vahet metaboomika ja metabonoomika vahel.
