Peamine erinevus genoomse DNA ja plasmiidi DNA eraldamise vahel on see, et genoomse DNA eraldamine on suunatud genoomse DNA ekstraheerimisele, samas kui plasmiidi DNA eraldamine on suunatud bakterite plasmiidi DNA ekstraheerimisele.
DNA eraldamine on keemiline protsess, mida kasutatakse DNA eraldamiseks erinevatest liikidest või erinevatest proovidest. DNA eraldamine on oluline molekulaarses bioloogias allavoolu, näiteks geelelektroforeesi, polümeraasi ahelreaktsiooni ja DNA järjestamise tehnikates. Seetõttu on molekulaarbioloogilistes uuringutes oluline DNA eraldamine. Uuringute eesmärgist lähtuvalt on mõnikord vaja genoomne DNA isoleerida. Lisaks keskendutakse mõnes uuringus plasmiidse DNA eraldamisele bakteritest. Genoomse DNA eraldamine on genoomse DNA eraldamise protsess prokarüootsest või eukarüootsest proovist. Isolatsiooni etapid erinevad vastavalt raku tüübile, milles DNA isoleerib. Plasmiidi DNA eraldamine on protsess, mille käigus eraldatakse plasmiidne DNA bakterirakust. Võrreldes genoomse DNA eraldamisegakogu protsess on plasmiidse DNA eraldamisel keeruline.