Peamine erinevus - korraldaja vs operaator
Muud DNA-järjestused kui geeni kodeeriv piirkond on ülitähtsad transkriptsiooniprotsessiga seotud erinevate funktsioonide täitmisel. Transkriptsioon on ensüümi katalüüsitud protsess, mis transkribeerib või muundab DNA ahela sarnaseks mRNA ahelaks. Elu keskses dogmas on DNA transkriptsioon mRNA-ks valgusünteesi esimene faas. Sellele järgneb translatsioon, mis muudab mRNA järjestuse aminohappeliseks järjestuseks, mis moodustab oodatava valgu. Organismides leiduvate erinevate järjestuste seas on transkriptsioonis suur roll promootorjärjestustel ja operaatorjärjestustel. Promootoreid on nii prokarüootides kui ka eukarüootides. Need paiknevad transkriptsiooni alguskohast ülesvoolu ja on kohad, kus RNA polümeraasi ensüüm seondub. Operaatorid esinevad ainult prokarüootides. Need on kohad, kus regulatiivne molekul seondub operoniga. Peamine erinevus promootori ja operaatori vahel põhineb molekuli tüübil, mis seondub vastava DNA järjestusega. RNA polümeraas seondub promootoriga, samas kui operoonisüsteemi reguleerivad molekulid seonduvad operaatoriga.
SISU
1. Ülevaade ja peamine erinevus
2. Mis on korraldaja
3. Mis on operaator
4. Sarnasused korraldaja ja operaatori vahel
5. Kõrvuti võrdlus - korraldaja vs operaator tabelina
6. Kokkuvõte
Mis on korraldaja?
Promootor on DNA järjestus, mis on paigutatud transkriptsiooni alguskohast ülesvoolu. Seda olulist DNA järjestust leidub nii eukarüootides kui ka prokarüootides; kuigi eukarüootsed promootorid võivad prokarüootsetest promootoritest erineda. Promootorid on DNA piirkonnad, millega RNA polümeraas seondub transkriptsiooniprotsessi käigus. See on peamine ensüüm, mis osaleb üheahelalise RNA (mRNA, tRNA, rRNA) tootmisel DNA matriitsist. Sõltuvalt RNA tüübist on RNA polümeraas erinev. Promootorjärjestused on kogu genoomis kõrgelt konserveerunud piirkonnad. Seetõttu on nad tuntud kui konsensuse piirkonnad. Promootori toimemehhanism erineb eukarüootidest ja prokarüootidest.
Eukarüootides nimetatakse promootorites leitud konserveerunud järjestust TATA kastiks, mis asub geeni -10 positsioonil. RNA polümeraasi seondumist TATA kastiga hõlbustavad seonduvad transkriptsioonifaktorid. See transkriptsioonifaktor muudab promootorjärjestuses kinnituse muutused ja suurendab selle afiinsust RNA polümeraasi seondumiseks. Seega koosneb transkriptsiooni initsiatsioonil moodustunud initsiatsioonieelne kompleks 7 transkriptsioonifaktoriga moodustatud kompleksist ja promootorsaidist. Kui see kompleks on moodustunud, seondub eukarüootne RNA polümeraas hõlpsasti promootoriga ja algatab transkriptsiooni.
Joonis 01: Korraldaja
Prokarüootides on mehhanism palju lihtsam, kuna need ei sisalda ühtegi transkriptsioonifaktorit. Selle asemel osaleb RNA polümeraasi sigmategur promootori äratundmises ja ensüümi kokkupanekus promootoril. Prokarüootides on kaks peamist konserveerunud promootorpiirkonda, TATA kasti vastav promootorjärjestus on tuntud kui “Pribnow Box”. Pribnow Box (positsioon -10) koosneb järjestusest TATAAT. Teist promootorjärjestust tuntakse kui -35 elementi, kuna see asub -35 asendis.
Mis on operaator?
Operaator on leitud prokarüootse geeni struktuuris. See on peamine DNA piirkond, millega seonduvad operoonisüsteemi reguleerivad molekulid. Lac-operaator on paljude prokarüootsete bakterite lac-operonis esinev operaatorjärjestus. Lac-operoni korral seondub repressormolekul operaatorpiirkonnaga. See seondumine takistab RNA polümeraasil operaatorist allavoolu asuvate geenide transkribeerimist.
Joonis 02: Operoni operaator
Eukarüootidel ei ole operaatorpiirkondi. Selle asemel seonduvad nende transkriptsiooni reguleerimisega seotud transkriptsioonifaktorid promootorpiirkondadega. Seega on prokarüootides operaatori peamine ülesanne reguleerida geeniekspressiooni.
Millised on korraldaja ja operaatori sarnasused?
- Nii korraldaja kui ka operaator koosnevad desoksüriboosi nukleiinhapetest (DNA).
- Nii promootori kui ka operaatori järjestused on transkriptsiooniprotsessis olulised.
Mis vahe on korraldajal ja operaatoril?
Erinev artikkel keskel enne tabelit
Korraldaja vs operaator |
|
| Promootorid on kohad, kus RNA polümeraas seondub, ja nad asuvad geeni transkriptsiooni alguskohast ülesvoolu. | Operaatorid on kohad, kus regulatiivne molekul seondub operoni mudeliga. |
| Organismi tüüp | |
| Promootoreid leidub nii prokarüootides kui ka eukarüootides. | Operaatoreid leidub ainult prokarüootides. |
| Funktsioon | |
| Promootor hõlbustab RNA polümeraasi ja transkriptsioonifaktorite (ainult eukarüootides) seondumist geeni transkriptsiooni jaoks. Prokarüootides soodustab promootorpiirkond RNA polümeraasi sigmateguri seondumist (prokarüootides). | Operaatorid reguleerivad geeniekspressiooni, hõlbustades regulatiivse molekuli seondumist operoniga. |
Kokkuvõte - korraldaja vs operaator
Promootor ja operaator on olulised DNA järjestused, mis osalevad transkriptsiooniprotsessis ja transkriptsiooni reguleerimises. Promootorjärjestusi leidub nii prokarüootides kui ka eukarüootides. Promootor on RNA polümeraasi seondumise koht. Need on kõrgelt konserveerunud piirkonnad, mida nimetatakse konsensuse järjestusteks. Eukarüootide karp TATA ja kast Pribnow ning prokarüootide promootor -35 on tavalised promootorid. Operaatorid esinevad ainult prokarüootides, kus nad kontrollivad geeni ekspressiooni, seondades repressori ja pärssides allavoolu asuvate geenide transkriptsiooni (lac operoni kontseptsioon) või seonduvad aktivaatoriga ja indutseerivad transkriptsiooni (trp operoni kontseptsioon). See on erinevus promootori ja operaatori vahel.
