Peamine erinevus epistaatilise geeni ja hüpostaatilise geeni vahel on see, et epistaatiline geen on geen, mis mõjutab teise geeni ekspressiooni erinevas asukohas, samas kui hüostaatiline geen on geen, mis allub epistaatilise geeni sekkumisele.
Teatud geenid sõltuvad oma ekspressioonist teistest mittealleelsetest geenidest. Epistasis on geenide vastasmõju vorm, mille korral üks geen segab või varjab teise geeni ekspressiooni, mis asub teises lookuses. Seega on see mingi alleeli geenide vastasmõju. Selles spetsiaalses geenide koostoimes suhtlevad kaks geeni ja need on epistaatiline geen ja hüostaatiline geen. Vastavalt on geen, mis varjab teise geeni ekspressiooni, tuntud kui epistaatiline geen, samas kui geen, mille ekspressioon on mõjutatud, on tuntud kui hüpostaatiline geen.
