Peamine erinevus geeni ja genoomi vahel on see, et geen on spetsiifiline DNA fragment, mis kodeerib valku, samas kui genoom on kogu organismi DNA kogu, mis sisaldab kogu geneetilist teavet.
Igal liigil on ainulaadne pärilike omaduste kogum, mis muudab need üksteisest erinevaks. Tavaliselt on need omadused kodeeritud nende rakkudes olevates DNA (deoksüribonukleiinhappe) molekulides. Geeni- ja genoomiomadused on liigiti väga erinevad. Pealegi on geen ja genoom kaks DNA-ga seotud mõistet. Geen on pärilikkuse põhiühik ja see on spetsiifiline kromosoomi DNA fragment, mis sisaldab valgu tootmiseks geneetilist koodi. Kogu kromosoomide komplekt esindab organismi genoomi ja see asub eukarüootide tuumas.