Peamine erinevus - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleaasid on nukleaasid, mis lagundavad RNA spetsiifiliselt väiksemateks üksusteks. Neid saab jagada kahte kategooriasse; endoribonukleaasid ja eksoribonukleaasid. Endoribonukleaas on endonukleaas, mis võib kas lagundada ühe- või kaheahelalist RNA-d. See lõhustab fosfodiestersidemed RNA polünukleotiidahelas. Näideteks on RNaas A, RNaas III, RNaas T1, RNaas P ja RNaas H. Exoribonukleaas on eksonukleaas, mis lagundas RNA, eemaldades terminaalsed nukleotiidid RNA molekuli 5'-otsast või 3'-otsast. Näideteks on RNaas R, RNaas II, RNaas D ja RNaas PH. Peamine erinevus RNASE A ja RNASE H vahel on see, et RNaas A on pankrease ribonukleaas, mis lagundab spetsiifiliselt üheahelalise RNA väiksemateks komponentideks, samas kui RNaas H on mittespetsiifiline ensüüm, mis lõhustab RNA-DNA hübriidis oleva RNA väiksemateks üksusteks hüdrolüütiline mehhanism.
SISU
1. Ülevaade ja peamine erinevus
2. Mis on RNASE A
3. Mis on RNASE H
4. Sarnasused RNASE A ja RNASE H vahel
5. Kõrvuti võrdlus - RNASE A vs RNASE H tabelina
6. Kokkuvõte
Mis on RNASE A?
RNaas A on pankrease ribonukleaas, mis lõhustab spetsiifiliselt paarimata tsütosiini ja uratsiili jäägid üheahelalise RNA 3'-otsas. RNaas H töötab kõrgemal soola kontsentratsioonil (0,3 M või suurem NaCl kontsentratsioon). Hüdrolüütiline reaktsioon on kaks etappi. See moodustab 3 'fosforüülitud saaduse 2', 3 'tsüklilise monofosfaadi vaheühendi kaudu. Ehkki see on spetsiifiline üheahelalisele RNA-le suurema soola kontsentratsiooni korral, võib see lagundada ka kaheahelalist RNA-d ja RNA-DNA hübriidis olevat RNA madalama NaCl kontsentratsiooni korral (madalam kui 0,3 M NaCl).
Bruce Merrifield sünteesis selle ensüümi kõigepealt. RNaas A on molekulaarsetes uuringutes väga populaarne ensüüm. Veise pankrease RNaas A on näide RNaas A-st. Ja see on üks kõvemaid ensüüme, mida laboris kasutatakse. See ensüüm ei vaja oma aktiivsuse jaoks kofaktorit. See on väga termostabiilne ensüüm. RNaas A on esimene ensüüm ja kolmas valk, millele tuvastati õige aminohappejärjestus. See ensüüm on väga väike, sisaldades 124 aminohapet ja molekulmassiga 12600da. Ja sellel on neli histidiinijääki (tema 12 ja 119, mis osalevad katalüütilises reaktsioonis).
Joonis 01: RNaas A
RNaasi A saab eraldada toorproovi keetmisega. Keemise korral lagundavad kõik teised ensüümid järelejäänud RNaasi A. RNaas A on hämmastavalt stabiilne ensüüm. See ensüüm pärsib ribonukleaasi inhibiitori valgu, raskmetallide ja uridiini vanadaadi komplekse.
Mis on RNaas H?
RNaas H on mittespetsiifiline ribonukleaasi ensüüm, mis võib hüdrolüütilise reaktsiooni abil lagundada RNA-DNA hübriidis olevat RNA-d. RNaas H lõikab RNA 3'- OP-sideme RNA-DNA hübriidis. Lõppkokkuvõttes toodab see 3'OH ja 5 'fosfaadiga lõppenud tooteid. DNA replikatsioonis mängib see keskset rolli, eemaldades RNA praimeri pärast uute DNA-ahelate moodustumist. Laboritingimustes lagundab see spetsiifiliselt RNA-DNA hübriid-RNA-d, kuid mitte DNA-d ja hübridiseerimata RNA-d. Ja seda ensüümi kasutatakse tavaliselt RNA matriitsi hävitamiseks pärast esimese komplementaarse DNA ahela moodustumist cDNA sünteesi käigus.
Joonis 02: RNaas H
RNaas H kasutab ka nukleaasikaitse testides. Seda saab lisada ka polü-A saba eemaldamiseks mRNA-st. RNaas H suudab hävitada mittekodeeriva RNA rakus ja väljaspool seda. Metalliioonid on selle valgu aktiivsuse jaoks vajalikud kofaktoritena. RNaas H ensüümi inhibeerimiseks võib kasutada kelaatorit (EDTA).
Millised on RNASE A ja RNASE H sarnasused?
- Mõlemad on oma olemuselt valgulised.
- Mõlemad on endoribonukleaasid
- Mõlemad võivad RNA-d lagundada.
- Mõlemad viivad läbi hüdrolüütilisi reaktsioone.
- Molekulaarsed laborid kasutavad neid mõlemaid.
Mis vahe on RNASE A ja RNASE H vahel?
Erinev artikkel keskel enne tabelit
RNASE A vs RNASE H |
|
| RNaas A on pankrease ribonukleaas, mis lõhustab spetsiifiliselt üheahelalise RNA paarimata tsütosiini ja uratsiilijääkide 3'-otsa suurema soolakontsentratsiooni juures. | RNaas H on mittespetsiifiline ribonukleaasi ensüüm, mis võib hüdrolüütilise reaktsiooni abil lagundada RNA-DNA hübriidis olevat RNA-d. |
| RNA lõhustumise olemus | |
| RNaas A lõhustab spetsiifiliselt üheahelalise RNA suurema soolakontsentratsiooni korral. | RNaas H lõikab RNA RNA-DNA hübriidis. |
| Koostegurite vajadus tegevuse jaoks | |
| RNaas A ei vaja oma tegevuse jaoks kofaktoreid. | RNaas H vajab oma tegevuse jaoks kofaktoritena metalliioone. |
| Valgu aktiivsuse inhibiitorid | |
| Ribonukleaasi inhibiitori valgu, raskmetalli ja uridiini vanadaadi kompleksid pärsivad RNAse A aktiivsust. | Kelaator (EDTA) pärsib RNaas H aktiivsust. |
| RNA praimeri eemaldamine DNA replikatsioonis | |
| RNaasi A ei kasutata RNA praimeri eemaldamiseks DNA replikatsioonis. | RNaas H-d kasutatakse RNA praimeri eemaldamiseks DNA replikatsioonis |
| DNA malli eemaldamine täiendava DNA (C-DNA) sünteesis | |
| RNaasi A ei kasutata RNA matriitsi eemaldamiseks komplementaarse DNA (C-DNA) sünteesi ajal. | RNaasi H kasutatakse RNA matriitsi eemaldamiseks komplementaarse DNA (C-DNA) sünteesi ajal. |
| Polü-A-saba eemaldamine oligoga hübridiseeritud mRNA-s (dt) | |
| RNaasi A ei kasutata “polü-A saba” eemaldamiseks oligoga hübridiseeritud mRNA-s (dt). | RNaasi H kasutatakse „polü-A saba“eemaldamiseks oligoga hübridiseeritud mRNA-s (dt) |
Kokkuvõte - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleaasid on nukleaasi ensüümid, millel on võime lõhustada RNA väiksemateks üksusteks. Neid on kahte tüüpi; endoribonukleaasid ja eksoribonukleaasid. Endoribonukleaas on endonukleaas, millel on võime lagundada ühe- või kaheahelalist RNA-d. Ja see lõhustab fosfodiestersideme RNA polünukleotiidahelas. RNaas A ja RNaas H on kaks endoribonukleaasi. RNaas A on pankrease ribonukleaas, mis lõhustab spetsiifiliselt paarimata tsütosiini ja uratsiili jäägid üheahelalise RNA 3 'otsas suurema soola kontsentratsiooni korral. RNaas H on mittespetsiifiline ribonukleaasi ensüüm, mis võib hüdrolüütilise reaktsiooni abil lagundada RNA-DNA hübriidis olevat RNA-d. See on erinevus RNaasi A ja RNaasi H vahel.
Laadige alla PDF RNASE A vs RNASE H
Selle artikli PDF-versiooni saate alla laadida ja kasutada võrguühenduseta eesmärkidel, nagu tsiteeritud. Laadige siit alla PDF-versioon. Erinevus RNASE A ja RNASE H vahel
