Peamine erinevus nukleotiidi ja nukleosiidi vahel on see, et nukleotiid sisaldab fosfaatrühma, samas kui nukleosiidil puudub fosfaatrühm.
Nukleosiidid ja nukleotiidid on sarnast tüüpi molekulid, mis erinevad kerge struktuurimuutusega. Nii nukleotiid kui ka nukleosiid koosnevad kahest samast komponendist; pentoosisuhkur ja lämmastikuga alus. Lisaks on nukleotiidil üks või mitu fosfaatrühma. Seega saab fosfaatrühma lisades nukleosiidi nukleotiidiks muuta ensüümide, mida nimetatakse kinaasiks. Nukleotiid on nukleiinhapete ehitusmaterjal. Teiselt poolt on nukleosiidid head vähivastased ja viirusevastased ained.
