Peamine erinevus DNA ja RNA nukleotiidi vahel seisneb selles, et DNA nukleotiid või desoksüribonukleotiid sisaldab deoksüriboosisuhkrut, samas kui RNA nukleotiid või ribonukleotiid sisaldab riboossuhkrut.
Nukleotiidid on nukleiinhapete põhiühik. Need on DNA ja RNA ehituskivid või monomeerid. Nad seovad omavahel polünukleotiidahelat, mis annab struktuuri DNA-le või RNA-le. Nukleotiidis on kolm põhikomponenti. Need on lämmastikuga alus, pentoosisuhkur (viis süsinikusuhkrut) ja fosfaatrühmad. On viis erinevat lämmastikalust nagu adeniin, tümiin, tsütosiin, guaniin ja uratsiil. Tümiini nähakse ainult DNA-s, samas kui uratsiil on RNA-le ainulaadne. Nukleiinhapetes on kahte tüüpi viit süsinikusuhkrut. RNA sisaldab riboossuhkrut, samas kui DNA sisaldab desoksüriboosisuhkrut. Nukleotiidid sisaldavad pentoossuhkru külge kinnitatud kolme fosfaatrühma.
