Peamine erinevus ksüleemi ja floemi vahel on see, et ksüleem on kude, mis juhib vett ja mineraale kogu taime kehas, samas kui floem on koe, mis juhib taime keha ümber suhkrut (toitu).
Trahheofüüdid on vaskulaarsed taimed, mis sisaldavad veresoonte süsteemi. Vaskulaarne süsteem on taimerakkude võrk, mis koosneb spetsiaalsetest kudedest ja seotud rakkudest. Nad kulgevad taime kere sees pikisuunas eraldi vaskulaarsete kimpude või torudena. Põhimõtteliselt hoolitseb veresoonte süsteem asjade transpordi eest taime keha ümber. Sel eesmärgil on taimedes kahte tüüpi juhtivaid elemente või kudesid, nimelt ksüleem ja floem. Ksüleem ja floem erinevad üksteisest nii struktuurselt kui ka funktsionaalselt. Seetõttu võime nende kahe põhjal arutada ksüleemi ja floemi erinevust.