Peamine erinevus homosügootse ja heterosügootse vahel on see, et homosügootne tähendab, et mõlemad alleelid on omaduse jaoks sarnased, samas kui heterosügootne tähendab, et tunnuse puhul on need kaks alleeli erinevad.
Vanemate kromosoomidest päritud geenid kontrollivad loomade, taimede ja kõigi teiste elusolendite kõiki märke või omadusi. See on peamine põhjus vanemate omaduste ilmutamiseks järglastel. Enamikul eukarüootsetest organismidest on kaks geenikomplekti, mida nimetatakse ema geenideks ja isageenideks. Seetõttu on geneetiline olukord tuntud kui diploidne (kaks kromosoomikomplekti). See tähendab; kõigil omadustel on geneetilised komponendid nii emalt kui isalt. Kuid need geenid võivad olla üksteise suhtes kas domineerivad või retsessiivsed ning seal saavad oluliseks homosügootsed ja heterosügootsed omadused. Homosügoot on seisund, kus on kaks domineerivat alleeli (AA) või kaks retsessiivset alleeli (aa), samas kui heterosügootne seisund on üks domineeriv alleel ja üks retsessiivne alleel (Aa).
