Peamine erinevus homosügootse ja hemizügootse vahel on see, et homosügoot on seisund, kus diploidse organismi mõlemad alleelid on ühesugused, samas kui hemizügootne seisund on ainult üks alleel.
Geenid eksisteerivad alleelide või koopiatena. Üldiselt on geenil kaks alleeli. Alleel on geeni versioon, mille tulemuseks on eristatav fenotüüpne toime. Alleelid võivad olla domineerivad või retsessiivsed. Domineerivad alleelid väljenduvad fenotüübis täielikult, samas kui retsessiivsed alleelid ei näita fenotüüpi, kui nad on domineerivate alleelidega. Homosügootsed, heterosügootsed, hemizügootsed ja nullizügootsed on erinevad zügootsuse tasemed. Homosügoot on sarnaste alleelide, kas kahe domineeriva alleeli või kahe retsessiivse alleeli, seisund. Hemizügootne on see seisund, kus geenil on ainult üks koopia või alleel.
