Peamine erinevus RP HPLC ja HIC vahel on see, et RP HPLC kasutab polaarsemat liikuvat faasi ja vähem polaarset statsionaarset faasi. HIC kasutab hüdrofoobset statsionaarset faasi, mis võimaldab hüdrofoobsetel molekulidel selle külge kinnituda.
Kromatograafia on analüütiline tehnika, mis aitab segu komponentideks eraldada. Kõigepealt peame lahutatava lahuse lahustama. Seda lahuse ja aine segu nimetatakse liikuvaks faasiks. Seejärel juhitakse liikuv faas läbi teise materjali, mida nimetatakse statsionaarseks faasiks. Statsionaarne faas määrab komponentide eraldatuse. Eraldamine toimub materjali jagamise tõttu liikuva faasi ja statsionaarse faasi vahel.