Peamine erinevus pöördfaasi ja normaalse faasi HPLC vahel on see, et pöördfaasi HPLC kasutab mittepolaarset statsionaarset faasi ja polaarset liikuvat faasi, samas kui tavalise faasi HPLC puhul kasutatakse polaarset statsionaarset faasi ja vähem polaarset liikuvat faasi.
Tavalise faasi HPLC on HPLC vanim tehnika, mida Tswett taimeekstraktide eraldamisel kasutas; ta kasutas kriiti klaaskolonnis. See oli klassikaline kromatograafia viis, mis viis selle nimetamise “tavaliseks” tehnikaks. Pöördfaasiline HPLC on aga vastupidine tavapärasele tehnikale, mille teadlased hiljuti välja töötasid.
