Peamine erinevus CRISPR-i ja restriktsiooniensüümide vahel on see, et CRISPR on looduslikult esinev prokarüootne immuunsuse kaitsemehhanism, mida on hiljuti kasutatud eukarüootsete geenide redigeerimiseks ja modifitseerimiseks, samas kui restriktsiooniensüümid on bioloogilised käärid, mis lõhustavad DNA molekule väiksemateks aineteks.
Genoomi redigeerimine ja geenide modifitseerimine on huvitavad ja uuenduslikud valdkonnad geneetikas ja molekulaarbioloogias. Geeniteraapia uuringutes kasutatakse laialdaselt geenide modifitseerimist. Pealegi on geeni modifitseerimine kasulik geeni omaduste, geeni funktsionaalsuse ja selle kohta, kuidas geeni mutatsioonid võivad selle funktsiooni mõjutada. Oluline on leida tõhusad ja usaldusväärsed viisid elusrakkude genoomis täpsete, sihipäraste muudatuste tegemiseks. CRISPR ja piirangute ensüümid mängivad geenimodifikatsioonides võtmerolli. CRISPR muudab geene suure täpsusega. Piiravad ensüümid töötavad bioloogiliste kääridena, mis lõhustavad DNA molekulid väiksemateks aineteks.