Peamine erinevus fluorestsentsi ja fosforestsentsi vahel on see, et fluorestsents peatub kohe, kui me valgusallika ära võtame, samas kui fosforestsents kipub veidi kauem püsima ka pärast kiiritava valgusallika eemaldamist.
Kui molekul või aatom neelab energiat, võib see läbi viia mitmesuguseid muutusi. Fluorestsents ja fosforestsents on kaks sellist protsessi. Lisaks ülaltoodud olulisele erinevusele on nende kahe termini vahel veel mõned erinevused, näiteks fluorestsentsprotsessis eralduv energia on suurem kui fosforestsentsil.
