Peamine erinevus geograafilise ja reproduktiivse isolatsiooni vahel on see, et geograafiline isolatsioon on reproduktiivse isolatsiooni kategooria, mis viitab organismide populatsioonide eraldamisele paaritumisest või nende geneetilise materjali vahetamisest füüsiliste piiride järgi, samas kui reproduktiivne isolatsioon viitab mehhanismidele, mis takistavad liike paaritumisest ja viljakate järglaste saamisest.
Viljastamine on sperma ja munaraku ühinemine seksuaalse paljunemise ajal diploidse sügoot moodustamiseks. Kui toodetud sigoot on küps, kasvab temast lõpuks terve viljakas järglane. seetõttu on reproduktiivne isoleerimine protsess, mis takistab viljaka järglase moodustumist. See ennetus võib ilmneda viljastamisprotsessi ajal või pärast viljastamist. Igatahes loob see lõpuks barjääri viljakate järglaste saamiseks, mis võib sünnitada teise viljaka järglase. Erinevate mehhanismide hulgas on geograafiline isolatsioon reproduktiivse isolatsiooni tegur.
