Peamine erinevus närvisüsteemi ja endokriinsüsteemi vahel seisneb selles, et närvisüsteem kasutab signaalide edastamiseks sihtrühma kehaosadele neuroneid mööda elektrilisi toimepotentsiaale, samas kui endokriinsüsteem kasutab kemikaale, mida nimetatakse vereringes hormoonideks, et suunata signaale sihtrakkudele ja organitele.
Närvisüsteem ja endokriinsüsteem on meie keha kaks peamist elundisüsteemi, mis vastutavad kogu kehas toimuva tegevuse reguleerimise eest. Need süsteemid hõlbustavad suhtlust rakkude, kudede ja elundite vahel. Samuti kasutavad nad selleks erinevaid mehhanisme. See tähendab, et närvisüsteem kasutab signaalide edastamiseks elektrilisi signaale või närviimpulsse, samas kui endokriinsüsteem kasutab kemikaale nagu hormoone signaalide saatmiseks keha sihtrühmadele. Pealegi koosneb närvisüsteem närvirakkude võrgustikust. Kusjuures endokriinsüsteem koosneb näärmete komplektist.