Peamine erinevus fukoidaani ja fukoksantiini vahel on see, et fukoidaan on fukoosi sisaldav sulfaaditud polüsahhariid, mis esineb pruunvetikate ja pruunvetikate eri liikides, samas kui fukoksantiin on ksantofüll, mis esineb lisavärvina pruunvetikate ja teiste heterokontside kloroplastides.
Mereökosüsteemid koosnevad nii taimestikust kui loomastikust. Neil on suur liikide mitmekesisus. Veelgi enam, need liigid sisaldavad erinevaid inimestele kasulikke ühendeid. Nendest liikidest mereökosüsteemides eraldatud biomolekulid sisaldavad erinevat terapeutilist potentsiaali. Fukoidaan ja fukoksantiin on kaks sellist ühendit, mis esinevad mereökosüsteemides, peamiselt pruunvetikates. Ehkki need erinevad keemiliselt, kasutatakse mõlemat ühendit praegu erinevatel uurimisotstarbel, et tuvastada nende potentsiaal raviainetena.