Peamine erinevus taksonoomia ja süstemaatika vahel on see, et taksonoomia on organismide taksonitesse klassifitseerimise distsipliin, korraldades need väga korrastatud viisil, samas kui süstemaatika on bioloogia lai valdkond, mis uurib liikide mitmekesistumist.
Taksonoomia ja süstemaatika on bioloogias väga tihedalt seotud erialad. Taksonoomias ja süsteemsuses on siiski huvitavaid erinevusi. Nende kahe väga lähedase sarnasuse tõttu eeldavad paljud meist, et neil on sarnane tähendus. Seetõttu on vaja neid kahte eriala põhjalikult uurida, et mõista taksonoomia ja süstemaatika tegelikku erinevust, sest paljud meist, sealhulgas põhibioloogid, on võib-olla segaduses.
