Peamine erinevus autonoomsete ja paratooniliste liikumiste vahel on see, et autonoomsed liikumised on reaktsioonid geenide mõjul taimes tekkinud stiimulile, paratonilised liigutused on aga taimede vastused välisele stiimulile ilma geenide osaluseta.
Taimed reageerivad välistele stiimulitele; nad reageerivad ka taime sees tekkivatele stiimulitele. Sellest lähtuvalt on kahte tüüpi liikumisi nagu autonoomsed liikumised ja paratonilised liikumised. Autonoomsed liikumised on vastused mõnele sisemisele põhjusele, eriti geenide kaasamise tõttu. Seevastu on paratoonilised liikumised vastused välistele stiimulitele, nagu soojus, rõhk, vesi, päikesevalgus jne. Geenide osalemise tõttu on autonoomsed liikumised taimedes sündides olemas, erinevalt paratonilistest liikumistest.