Kimera ja mosaiigi peamine erinevus on iga organismi moodustumisega seotud sigootide arv. Erinevad rakupopulatsioonid pärinevad kahest kimääris olevast sügootist, samas kui erinevad rakupopulatsioonid pärinevad mosaiigi ühest sigoodist.
Kimäär ja mosaiik olid algselt geneetilise kombinatsiooni müütilised mõisted. Geneetika ja molekulaarbioloogia edenemisega on aga nüüd võimalik kimäärismi ja mosaiigi nähtusi teaduslikult seletada. Nii kimerismis kui ka mosaiigis on mõnel keharakul erinev genoom. Seega võib sama kude sisaldada kahte või enamat erinevat rakupopulatsiooni. Lisaks osalevad kaks sügootid kimääriks areneva embrüo moodustamisel, samal ajal kui üks sigoot osaleb mosaiigiks areneva embrüo moodustumisel. Varase arengu mutatsioon on mosaiikimise põhjus, samas kui kimerismi põhjuseks on kahe erineva sügoodi kaasamine.
