Peamine erinevus ioonsete ja binaarsete ühendite vahel on see, et ioonsed ühendid sisaldavad kahte laetud komponenti, binaarsed ühendid aga kahte erinevat keemilist elementi.
Ioonsed ühendid on binaarsed ühendid, mis kuuluvad kahte erinevasse kategooriasse. Ioonilised ühendid kuuluvad kovalentsete ühendite alla, kui analüüsime keemilisi ühendeid vastavalt molekulis esinevate keemiliste sidemete tüübile. Teiselt poolt kuuluvad binaarsed ühendid ühendite klassifikatsiooni alla sõltuvalt molekulis leiduvatest keemilistest elementidest.