Pepsiini ja reniini peamine erinevus seisneb selles, et pepsiin, mis on üks peamisi seedetrakti ensüüme, on mao sekreteeritav proteaas, reniin aga ensüüm ja ka neeru juxtaglomerulaarsete rakkude toodetud hormoon.
Proteaasid on ensüümid, mis hüdrolüüsivad peptiidsidemeid ja lagundavad valgud peptiidideks või aminohapeteks. Pepsiin on maomahlas sisalduv proteaas. See on üks peamisi seedetrakti ensüüme, mis lõhustab valgulised toidud peptiidideks ja aminohapeteks. Seevastu reniin on ensüüm ja asparagiinproteaas. See on reniini-angiotensiini süsteemi algne ensüüm. Reniin töötab hormoonina ja aitab kontrollida vererõhku.
