Peamine erinevus AMPA ja NMDA retseptorite vahel on see, et AMPA retseptori spetsiifiline agonist on alfa-amino - 3 - hüdroksüül - 5 - metüül - 4 - isoksasoolpropioonhape (AMPA), samas kui NMDA retseptori spetsiifiline agonist on N - metüül - D - aspartaat (NMDA).
Glutamaadi retseptoreid on kolme peamist tüüpi. Nende erinevus põhineb agonistil, mis seondub glutamaadiga seondumise retseptori aktiveerimiseks. Glutamaadiga seondumine avab iooniga piiratud kanalid naatrium- ja kaaliumioonide transportimiseks. Samuti hõlbustavad NMDA retseptorid ka kaltsiumiioonide voogu üle membraani.
