Peamine erinevus happelise hüdrolüüsi ja ensümaatilise hüdrolüüsi vahel on see, et happeline hüdrolüüs on keemiline protsess, samas kui ensümaatiline hüdrolüüs on biokeemiline protsess.
Hüdrolüüs viitab keemiliste sidemete lõhustamisele veemolekuli lisamisega. See võib toimuda kahel viisil: keemiliste või bioloogiliste vahenditega. Kui see toimub keemiliselt, nimetame seda happe hüdrolüüsiks ja sideme lõhustamise põhjuseks on keemiline liik (hape). Bioloogiliste vahendite abil toimuvat hüdrolüüsi nimetatakse ensümaatiliseks hüdrolüüsiks, kuna sideme lõhustamine toimub selles protsessis ensüümide juuresolekul.