Peamine erinevus platokinooni ja plastotsüaniini vahel on see, et plastoquinone on lipofiilne kandemolekul, mis kannab elektronid plastotsüaniini tsütokroom b6f valgu kompleksi kaudu. Aga Plastotsüaniini on väike vees lahustuvat sinist vase valk, mis võtab vastu elektronpaari alates tsütokroom b 6 f keerulised ja läbib seda fotosüsteemi I kasutamine tülakoidmembraani-de ruumi.
Fotosünteesil on kahte tüüpi reaktsioone: valgusest sõltuvad reaktsioonid ja valgusest sõltumatud reaktsioonid. Need kahte tüüpi fotosüsteemid mängivad valgusest sõltuvates reaktsioonides olulist rolli. Need on I ja II fotosüsteem. Fotosüsteemid on suured valkude ja pigmentide või valgust neelavate molekulide kompleksid. Nad püüavad päikesevalgusest energiat. P700 on I fotosüsteemi reaktsioonikeskus, samas kui P680 on II fotosüsteemi reaktsioonikeskus. Iga fotosüsteem neelab valgust ja toodab fotofosforüülimise teel ATP-d. Nad toodavad ka NADPH-d. Valgusest sõltuvates reaktsioonides osalevad mitut tüüpi elektronide aktseptorid. Plastokinoon ja plastotsüaniin on kahte tüüpi molekule, mis osalevad elektronide transpordiahelas.
