Peamine erinevus TMR-i ja röntgenkristallograafia vahel on see, et NMR on analüüsimeetod, mida kasutatakse orgaanilise molekuli aatomite tüübi ja arvu määramiseks, samas kui röntgenkristallograafia on analüütiline tehnika, mida kasutatakse kristalli aatomi ja molekulaarse struktuuri määramiseks.
Termin NMR tähistab tuumamagnetresonantsi. See termin kuulub analüütilise keemia alateema spektroskoopia alla. Röntgenkristallograafia on seevastu teatud tüüpi kristallograafiline tehnika, milles kristallide analüüsimiseks kasutame röntgenkiirt.