Video: ShRNA Ja SiRNA Erinevus
2024 Autor: Mildred Bawerman | [email protected]. Viimati modifitseeritud: 2023-12-16 08:38
shRNA vs siRNA
RNA-interferentsi (RNAi) käigus lüüakse sihtgeeni ekspressioon suure spetsiifilisuse ja selektiivsusega alla. RNAi on loomulik protsess ja see hõlmab väikest sekkuvat RNA-d (siRNA) ja lühikese juuksenõelaga RNA-d (shRNA) ja kahefunktsionaalset shRNA-d. Praegu kasutatakse RNAi laialdaselt isikupärastatud vähiteraapia vahendina. RNAi rakendused tehakse põhimõtteliselt keemiliselt sünteesitud kaheahelaliste siRNA ja vektoripõhiste shRNA molekulidega. Kuigi neil kahel molekulil on sarnased funktsionaalsed tulemused, erinevad nad oma struktuuri poolest; seega erinevad ka nende kahe molekuli toimemehhanismid, RNA teed ja sihtmärgivälised mõjud.
shRNA
shRNA on väikese RNA molekuli järjestus, mis teeb tiheda juuksenõela pöörde, mida saab kasutada märklaudgeeni ekspressiooni vaigistamiseks RNAi ajal. ShRNA ekspressioon saavutatakse vektoriga, mis võib olla kas viirus või bakter, või plasmiidide kohaletoimetamise teel. Need sünteesitakse rakutuumas ja transporditakse edasiste protsesside jaoks tsütoplasmasse. Nendel molekulidel on miRNA sarnased küpsemisrajad; seega on miRNA süntees andnud aluse shRNA sünteesi mõistmiseks. Kumbki RNA polümeraas II või III võib transkribeerida shRNA RNA polümeraas II või III promootorite kaudu. ShRNA-de kasutamise eeliseks on see, et nende lagunemiskiirus ja voolavus on suhteliselt madal. Puuduseks on see, et see vajab ekspressioonivektorit, mis võib põhjustada mõningaid ohutusprobleeme.
siRNA
siRNA-d on kaheahelalised RNA molekulid, mis koosnevad pikkusest 20-25 aluspaari. Neid kasutatakse geenide supressiooniks, summutades kõik geenid RNAi raja komplementaarse nukleotiidjärjestusega. SiRNA transfektsiooni teel toimuv geeni koputamine on mööduva efekti tõttu sageli ebaõnnestunud; eriti kiiresti jagunevates rakkudes ja supressioon ei kesta kauem. Selle probleemi lahendamiseks modifitseeritakse siRNA-d lühikese juuksenõela struktuuri kasutuselevõtuga. See modifitseeritud molekul oli siis tuntud kui shRNA. shRNA tuleks muundada siRNA-ks Diceri poolt, et jätkata selle normaalset funktsiooni.
Mis vahe on shRNA ja siRNA vahel?
• Erinevalt siRNA-st on shRNA-l täiendav juuksenõelastruktuur. shRNA on siRNA modifitseeritud versioon.
• shRNA nõuab ekspressioonivektorit, siRNA aga mitte.
• shRNA-d saab kasutada pikaajaliseks koputamiseks, siRNA-d saab kasutada ainult lühiajaliseks geenide koputamiseks.
• Erinevalt siRNA geenide supressioonist on shRNA supressioon pikaajaline ja kui see sisestatakse sobiva viirusvektori kaudu, võib see põhjustada püsivat geeni vaigistavat toimet.
• Dicer on vajalik, et muuta shRNA tagasi siRNA molekuliks, et täita selle normaalseid funktsioone.
Soovitatav:
Sümmeetriliste Ja Asümmeetriliste Tippmolekulide Erinevus
Põhiline erinevus sümmeetriliste ja asümmeetriliste tippmolekulide vahel on see, et sümmeetrilistel tippmolekulidel on üks õige pöörlemistelg ja kaks inertsimomenti
Erinevus Transgeensete Ja Väljalangevate Hiirte Vahel
Peamine erinevus transgeensete ja knockout-hiirte vahel on see, et transgeensete hiirte genoomi on sisestatud võõrgeenid, samas kui knockout-hiirtel
Erinevus Tsisgeneesi Ja Intrageneesi Vahel
Peamine erinevus tsisgeneesi ja intrageneesi vahel on see, et tsisgeneesis sisestatakse geenid ilma DNA järjestust muutmata ja ge
Erinevus Tõusva Ja Kahaneva Paberikromatograafia Vahel
Peamine erinevus tõusva ja kahaneva paberikromatograafia vahel on see, et tõusev paberikromatograafia hõlmab lahusti liikumist
SiRNA Ja MiRNA Erinevus
SiRNA vs miRNA RNA-d on väga olulised molekulid, mis aitavad organismide elu üles ehitada. Hiljuti on teadlased avastanud väikesed RNA-d, mida nimetatakse