siRNA vs miRNA
RNA-d on väga olulised molekulid, mis aitavad organismide elu üles ehitada. Hiljuti on teadlased avastanud väikesed RNA-d, mida nimetatakse RNA-interferentsiks või RNA-deks, mis toimivad pärast transkriptsiooni geeniekspressiooni kontrollimiseks. Väikeste RNA-de kaks peamist tüüpi on mikro-RNA või miRNA ja väike segav RNA või siRNA. Need molekulid reguleerivad põhiliselt geeni ekspressiooni, surudes maha sihtgeeni. Nii miRNA kui ka siRNA biogeneesi teed on väga sarnased, kuigi nende vahel on mõningaid erinevusi. MiRNA ja siRNA päritolu pärineb dsRNA molekulidest. Küpsed miRNA-d on struktuurilt sarnased siRNA molekulidega.
miRNA
Mikro-RNA-d või miRNA-d on väikesed RNA molekulid, mis vahendavad translatsioonigeenide regulatsiooni viimast kontrolli. MiRNA tühistamine võib põhjustada vähki ja muid haigusi. Seetõttu on miRNA mittekodeerivas piirkonnas kodeeritud teabe õige reguleerimine paljudes rakulistes põhiprotsessides väga oluline.
siRNA
siRNA-d nimetatakse ka lühikeseks segavaks või vaigistavaks RNA-ks ja need koosnevad 20–25 aluspaariga kaheahelalisest RNA-st. SiRNA peamine roll on segada spetsiifiliste geenide ekspressiooni komplementaarsete nukleotiidjärjestustega. siRNA koosneb lühikesest kaheahelalisest RNA-st, millel on fosforüülitud 5 'otsad ja hüdroksüülitud 3' otsad, millel on kaks üleulatuvat nukleotiidi.
Mis vahe on siRNA ja miRNA vahel?
• spetsiifilistest genoomilistest lookustest pärinev miRNA, samas kui mRNA, transposoonid, viirused või heterokromaatiline DNA on saadud siRNA.
• miRNA sünteesi töödeldakse pikematest prekursori juuksenõela transkriptidest (primaarne tuuma miRNA järjestus RNaas III endonukleaasi abil), samas kui pikkadest bimolekulaarsetest RNA dupleksidest töödeldud siRNA.
• Iga miRNA juuksenõela eelkäija molekul toodab ühe miRNA dupleksi, samas kui iga siRNA eelkäija molekul toodab mitu siRNA dupleksi.
• siRNA järjestused on harva konserveerunud, miRNA järjestused on aga hästi konserveerunud.
• SiRNA kõik alused aitavad kaasa selle sihtmärgi spetsiifilisusele, samas kui ainult 5 'pool miRNA-st aitab kaasa selle sihtmärgi spetsiifilisusele.
• miRNA seondub sageli sihtranskriptide 3'transleerimata piirkonnaga, samas kui siRNA-d moodustavad komplementaarse dupleksi kõikjal sihtmärgi mRNA-s.
• miRNA määrab heterosummutamise, siRNA aga automaatse vaigistuse.
• miRNA toimib signaalina, mis takistab translatsiooni, siRNA aga takistab füüsiliselt translatsiooni.
