Peamine erinevus VNTR ja sondi vahel on see, et VNTR on lühike nukleotiidjärjestus, mis esineb genoomis tandemkordusena, samas kui sond on kunstlikult sünteesitud lühike DNA või RNA järjestus, mida saab radioaktiivselt märgistada.
VNTR tähistab muutuva arvuga tandemkorda. See on lühike nukleotiidjärjestus, mis on korraldatud genoomis tandemkordustena. VNTR-id on meie genoomis looduslikult esinevad. Sond on kunstlikult sünteesitud lühike DNA või RNA järjestus. Nii sond kui ka VNTR on nukleiinhapped või lühikesed nukleotiidjärjestused. Neid on tohutult kasutatud erinevates molekulaarbioloogilistes tehnikates, peamiselt kohtuekspertiisides. VNTR-il ja sondil on mõned sarnasused ja erinevused. Seega püüab artikkel välja tuua erinevuse VNTR ja sondi vahel.