Peamine erinevus - plasmiid vs Transposon
Bakterid sisaldavad kromosomaalset ja mitte-kromosomaalset DNA-d. Kromosomaalsel DNA-l on bakterite paljunemisel oluline roll. Mittekromosoomne DNA ei kodeeri bakterite ellujäämiseks olulisi geene. Plasmiid on prokarüootse mittekromosoomse DNA tüüp. Need on väikesed ümmargused kaheahelalised DNA-d, mis pakuvad bakteritele täiendavaid geneetilisi eeliseid. Transposoon on DNA järjestus, mis võib liikuda genoomis uutesse positsioonidesse. Neid tuntakse ka kui bakterite liikuvat geneetilist materjali. Peamine erinevus plasmiidi ja transposooni vahel on see, et plasmiid on mitte-kromosoomne DNA, mis paljuneb bakteris iseseisvalt, samas kui transposoon on kromosomaalse DNA segment, mis translokatseerub bakterite genoomis ja muudab kromosoomi geneetilist järjestust.
SISU
1. Ülevaade ja peamine erinevus
2. Mis on plasmiid
3. Mis on transposoon
4. Võrdlus kõrvuti - plasmiid vs transposoon
5. Kokkuvõte
Mis on plasmiid?
Plasmiid on prokarüootide ekstrakromosomaalne DNA. See võib paljuneda bakterikromosoomist sõltumatult. Ühe bakteri sees võib olla mitu plasmiidi. Plasmiidid on suletud ümmargused DNA tükid ja nende suurus on väike. Plasmiidne DNA kannab mõnda geeni, mis ei ole bakteri ellujäämiseks hädavajalikud. Need plasmiidides olevad geenid pakuvad bakteritele täiendavaid geneetilisi eeliseid, näiteks antibiootikumiresistentsus, herbitsiidiresistentsus, raskmetallitaluvus jne. Spetsiaalsed plasmiidid, mida nimetatakse F-faktori plasmiidideks, on seotud bakterite konjugeerimisega, mis on seksuaalne paljunemismeetod.
Rekombinantse DNA tehnoloogia ja geenide kloonimisel kasutatakse vektoritena plasmiide. Plasmiididel on erilised omadused, mis muudavad need sobivaks kasutamiseks rekombinantsete vektoritena geenitehnoloogias. Need sisaldavad replikatsiooni alguspunkti, selekteeritavaid markergeene, kaheahelalist laadi, väikest suurust ja mitut kloonimissaiti. Teadlased saavad rekombinantse DNA saamiseks hõlpsasti avada plasmiidi DNA ja sisestada soovitud DNA fragmendid või geenid plasmiididesse. Lisaks on rekombinantse plasmiidi muundamine peremeesbakteriks lihtsam kui teistel vektoritel.
Joonis 01: Plasmiidid
Mis on transposoon?
Transposoon on DNA fragment või järjestus, mis võib translokatseeruda bakteri genoomis. Need on liikuvad DNA järjestused. Nad liiguvad genoomi uutesse kohtadesse. Need liikumised muudavad bakterite genoomi järjestust, põhjustades olulisi muutusi geneetilises informatsioonis. Need on ülekantavad geneetilised elemendid, mis vastutavad bakterites uute geneetiliste järjestuste loomise eest. Esmakordselt avastas transposoonid Barbara McClintock 1940. aastatel maisiga läbi viidud katsete abil ja ta pälvis oma töö eest Nobeli preemia.
Transposoone nimetatakse mõnikord hüppavateks geenideks, kuna need hüppavad järjestused võivad blokeerida geenide transkriptsiooni ja korraldada ümber bakteri geneetilise materjali. Nad vastutavad ka ravimiresistentsuse, antibiootikumiresistentsuse geenide liikumise eest plasmiidide ja kromosoomide vahel.
Lähtuvalt mehhanismist, mida nad kasutavad liikumiseks ja sisestamiseks, on kahte tüüpi transposoone. Need on I klassi transposoon (retrotransposoonid) ja II klassi transposoon (DNA transposoonid). I klassi transposoonides kasutatakse kopeerimise ja kleepimise mehhanismi, II klassi transposoonides aga lõikamis- ja kleepimismehhanismi.
Transposoon võib liikuda plasmiidist kromosoomi või kahe plasmiidi vahel. Nende liikumiste tõttu segunevad geenid bakteriliikide vahel. Seega kasutatakse transposoone geenitehnoloogias vektoritena geneetiliste järjestuste eemaldamiseks ja integreerimiseks organismidesse.
Joonis 02: Bakteri DNA transposoon
Mis vahe on plasmiidil ja transposoonil?
Erinev artikkel keskel enne tabelit
Plasmiid vs Transposon |
|
| Plasmiid on väike ümmargune kaheahelaline bakterite mittekromosoomne DNA. | Transposoon on DNA segment, mis on võimeline liikuma genoomis uutesse kohtadesse. |
| Enesereplikatsioon | |
| Plasmiidid on võimelised paljunema kromosomaalsest DNA-st sõltumatult. | Transposoonid ei suuda iseseisvalt paljuneda. |
| Kodeeritud eripärad | |
| Plasmiidid pakuvad mitmeid funktsioone, nagu antibiootikumiresistentsus ja virulentsus. | Transposoonid ei kodeeri erilisi tunnuseid. |
| Kasutage vektorina | |
| Rekombinantse DNA valmistamiseks kasutatakse plasmiide geenitehnoloogias vektoritena. | Transposoone kasutatakse geenitehnoloogias vektoritena ka insertsioonse mutageneesi jaoks. |
| Mutatsioonid ja järjestuse muutused | |
| Plasmiidid ei suuda põhjustada olulisi mutatsioone ning muuta genoomi järjestust ja suurust. | Üleviimine võib luua olulisi mutatsioone ning muuta genoomi järjestust ja suurust. |
Kokkuvõte - plasmiid vs Transposon
Plasmiid on ekstrakromosomaalne DNA, mida tavaliselt leidub bakterites. Sellel on võime paljuneda sõltumatult bakterite kromosomaalsest DNA-st. Plasmiidid sisaldavad geene, mis lisavad bakteritele geneetilisi eeliseid. Kuid plasmiidne DNA ei ole bakterite ellujäämiseks hädavajalik. Transposoonid on mobiilsed geneetilised elemendid, mis hüppavad genoomis ühest kohast uude kohta. Nad on võimelised tekitama mutatsioone ja muutma genoomi suurust ja järjestust. See on erinevus plasmiidi ja transposooni vahel.
