Peamine erinevus plasmiidi ja kromosoomi vahel on see, et plasmiid on ümmargune kaheahelaline bakterite kromosoomiväline DNA-struktuur, samas kui kromosoom on hästi organiseeritud niiditaoline struktuur, mis sisaldab valkudega tihedalt kokku keeratud genoomset DNA-d.
Bakterirakk sisaldab kromosoomi ja mitmeid kromosoomiväliseid DNA ringe, mida nimetatakse plasmiidideks. Bakteriaalne kromosoom sisaldab bakterite genoomset DNA-d. Lisaks eksisteerib eukarüootne genoomne DNA ka kromosoomidena. Inimese genoomil on 46 kromosoomi. Üldiselt esinevad plasmiidid bakterites ja arheedes. Kuigi bakteritel on plasmiidid, ei sisalda plasmiidid geene, mis on bakterite ellujäämiseks ja nende peamisteks funktsioonideks hädavajalikud. Kuid plasmiidid sisaldavad mitmeid geene, mis pakuvad bakteritele täiendavaid eeliseid, nagu antibiootikumiresistentsus, põuakindlus, resistentsus herbitsiidide vastu jne. Selle artikli eesmärk on üksikasjalikult arutada plasmiidi ja kromosoomi erinevust.
