Peamine erinevus kromosoomi ja kromatiidi vahel on see, et kromosoom on DNA molekuli pikk niiditaoline vorm, samas kui kromatiid on pool kahest replitseeritud kromosoomi identsest koopiast. Tegelikult on kaks kromatiidi ühendatud tsentromeeriga, moodustades kromosoomi.
Kromosoom ja kromatiid on tihedalt seotud struktuurid, mis on valmistatud DNA molekulidest. Kromosoomid sisaldavad geneetilist teavet spetsiifiliste DNA järjestuste või geenide kujul. DNA ühte ahelat nimetatakse kromosoomiks ja kaks kromatiidi moodustavad ühe kromosoomi. Kromosoomid on ühe organismi vektorid või geneetilise materjali kandumine teise organismi, samas kui kromatiidid võimaldavad neil rakkudel dubleeruda.