Põhiline erinevus tsüanobakterite ja vetikate vahel on see, et tsüanobakterid on prokarüootsete bakterite rühm, vetikad aga väikesed eukarüootsed taimetaolised organismid.
Fotosüntees on äärmiselt oluline protsess, mis muudab päikesevalguse energia süsivesikute keemiliseks energiaks. Seega võimaldab see protsess teatud organismidel ise toitu valmistada ja neid organisme tuntakse fotoautotroofidena. Samuti on rohelised taimed, vetikad ja sinivetikad kolme tüüpi fotoautotroofe. Nende kolme tüübi seas on tsüanobakterid prokarüoodid, mis on bakterid. Teiselt poolt on rohelised taimed ja vetikad eukarüootsed organismid. Tsüanobaktereid ja vetikaid arvestades on need erinevalt rohelistest taimedest mikroskoopilised organismid. Tsüanobakterid ja vetikad erinevad üksteisest aga peamiselt rakulise organisatsiooni poolest. Selle artikli eesmärk on selgitada erinevust tsüanobakterite ja vetikate vahel.
