Peamine erinevus viiruse ja viroidide vahel on see, et viirus on kohustuslik parasiit, mis koosneb kas RNA või DNA genoomist ja valgukapsiidist, samas kui viroidid on nakkavad osakesed, mis koosnevad üheahelalistest ümmargustest RNA molekulidest.
Taimedele, loomadele ja teistele organismidele haigusi põhjustavaid nakkusetekitajaid on erinevat tüüpi. Nende hulgas on bakterid, seened, algloomad, viirused, viroidid ja prioonid tuntud nakkusetekitajad. Viirused ja viroidid on väga väikesed osakesed. Mõlemad tüübid on kohustuslikud parasiidid. Viirus sisaldab RNA või DNA genoomi, mida ümbritseb valgu kapsiid. Viroidid on siiski üheahelalised ümmargused RNA molekulid. Need ei sisalda valgukapsideid. Samamoodi on viiruse ja viroidide vahel palju olulisi erinevusi. Seega käsitleb see artikkel viiruse ja viroidide erinevuse uurimist.