Peamine erinevus vaba kloori ja üldkloori vahel on see, et vaba kloor on kloori kogus, mis võib inaktiveerida vees esinevaid patogeenseid mikroorganisme, samas kui üldkloor on ühendatud kloori ja vaba kloori summa. Vaba kloori väärtus on alati väiksem kui kogu kloori väärtus.
Kombineeritud kloor on kloori kogus, mis reageerib vees leiduvate lämmastikku sisaldavate ühenditega. Seetõttu pole see kloor vee desinfitseerimiseks saadaval. See tähendab, et mõiste üldkloor annab kloori üldkoguse, mis on kättesaadav ja pole kättesaadav patogeensete (haigusi põhjustavate) mikroorganismide inaktiveerimiseks vees.