Peamine erinevus borasiini ja benseeni vahel on see, et borasiin sisaldab tsükli struktuuris kolme boori aatomit ja kolme lämmastiku aatomit, benseen sisaldab tsükli struktuuris kuut süsiniku aatomit.
Nii borasiinil kui benseenil on kuueliikmelise tsükliga sarnane struktuur ja need kaks ühendit on isoelektroonilised. See tähendab, et nii borasiinil kui ka benseenil on sama elektronide arv või sama elektrooniline struktuur. Kuid neil on täiesti erinevad keemilised ja füüsikalised omadused, kuna nende ühendite rõngad koosnevad erinevatest aatomitest.